Für das Controlling der Kosten von Aufgaben werden SAP CO Aufträge angelegt. Bei der Anlage einer Aufgabe (eines Issues) in Jira wird dem Issue ein SAP CO Auftrag zugeordnet. Für die Zuordnung wird in Jira eine Suchhilfe in Form einer Liste bereitgestellt, die verwendbare SAP CO Aufträge sucht und anzeigt. Die Inhalte für die Liste werden synchron aus dem SAP-System gelesen.

Mit Hilfe der Issues in Jira werden die Aufgaben zeitlich und personell gesteuert. Im Rahmen der Bearbeitung der Aufgaben entstehen Kosten in Form von zeitlichen oder finanziellen Aufwänden. Beide Aufwände werden in Jira dokumentiert und im Fall von zeitlichen Aufwänden mit einem Faktor für die Umrechnung versehen. Die Gesamtkosten einer Aufgabe werden an den SAP CO Auftrag gebucht, sobald eine Aufgabe einen definierten Status erreicht hat.